館內(nèi)展廳共分三層，主要由一樓的原始社會——南北朝時期展廳、隋唐五代時期展廳、運(yùn)河廳，二樓的兩宋時期展廳、元明清時期展廳、百年老店、臨時展廳，三樓的郵票展廳、書畫廳組成。陳列品以歷年杭州出土的珍貴、精品文物為主，全面又重點(diǎn)地反映了杭州的歷史面貌，并運(yùn)用先進(jìn)的聲、光、電技術(shù)豐富展示效能，營造出了感性直觀的游覽認(rèn)知氛圍。

該館展品中有國寶級文物戰(zhàn)國水晶杯、越窯褐彩青瓷汕燈，展出的國家二級以上文物共200余件，包括良渚時期玉石器、吳越石刻星象圖等。館內(nèi)還運(yùn)用各種高科技手段，展示宋代大運(yùn)河沿岸模擬景觀、杭州百年老店風(fēng)情等。